牦牛CAPN2基因的电子克隆及生物信息学分析

作者：刘仲娜; 柴志欣; 曾贤彬; 钟金城

来源：生物技术, 2013, (01): 42-45.

• 牦牛
• EST
• 电子克隆
• CAPN2基因 yak
• EST
• silico cloning
• CAPN2 gene

目的:对牦牛CAPN2基因进行电子克隆和序列分析,以期为进一步研究牦牛该基因与其肉质性状相关性以及基因结构和表达奠定理论基础。方法:利用人的CAPNA2基因cDNA序列为探针,在EST数据库进行同源性筛选,运用CAP3进行拼接得到完整序列并结合生物信息学进行序列分析。结果:牦牛CAPN2基因全长3 200bp,包含一个2 103bp的开放阅读框,共编码700个氨基酸;牦牛CAPN2的核苷酸序列与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%。经聚类分析,牦牛首先与普通牛聚在一起,然后与羊、猪聚为一类;人与小鼠聚为一类;这两类相聚为...

• 单位
  西南民族大学