2018年青海省手足口病病原谱的构成及基因特征分析

作者:范丽霞; 汪春翔; 赵生仓; 李崇亥; 王晓彤; 任丽萍; 严冬梅; 冀天娇; 刘桂香*
来源:中国病原生物学杂志, 2020, 15(11): 1320-1323.
DOI:10.13350/j.cjpb.201116

摘要

目的了解2018年青海省手足口病(HFMD)病原谱的构成及基因特征,掌握HFMD主要致病原的流行规律。方法采集青海省HFMD患者的咽拭子标本共713份,进行实时荧光定量检测和病毒分离;对阳性标本进行特异性引物核酸扩增和测序分析,参考NCBI部分毒株序列构建基因进化树。结果 2018年共采集临床确诊HFMD患者标本713份,检测到EV-A71型病毒9份,CVA16型病毒109份,CVA6型病毒510份,CVA10型病毒12份,CVA4型病毒5份,CVA2型病毒2份,柯萨奇B组病毒4份,阴性3份。其中CVA6病毒占总数的71.53%,CVA16病毒占15.29%。经测序后选取典型的15株柯萨奇病毒A、B组基因序列进行核酸序列分析,同源性在23.5%-100%之间,表明引起青海HFMD流行的非EV-A71、CVA16型柯萨奇病毒A、B组核酸序列不同基因型之间的变异性强。结论 2018年青海省HFMD病毒谱包括EV-A71、CVA16、CVA6等,主要为CVA6,其次是CVA16。