科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
玉米象Sitophilus zeamais是一种世界性的储粮害虫,但其基因信息尚不完善。本研究利用高通量测序平台Illumina HiSeq TM2000对玉米象成虫进行转录组测序,总计获得64 358条unigenes,总长度39 481 752 bp,最短201 bp,最长29 046 bp,平均长度613 bp。将unigenes序列在7大数据库Nr、GO、Swissprot、KOG、Pfam、KEGG、TrEMBL中进行注释,分别有25 271、20 747、16 477、12 060、9 471、3 370、25 500条unigenes获得注释。通过GO功能分类,共有20 747条unigenes在GO数据库中生物学过程、细胞组分、分子功能3大类68个亚类功能组中找到对应。KOG结果显示,12 606条unigenes归到25个基因家族。通过KEGG代谢通路分析,共有3 370条unigenes被注释,分别归属于细胞进程、环境信息进程、遗传信息进程、新陈代谢和有机体系统5大类代谢途径,共33个亚类274个功能通路。进一步的数据分析,共鉴定出146 081个SNP位点和5 002个简单序列重复(SSR)位点。本研究获得的玉米象转录组信息,为玉米象的功能基因挖掘提供了重要的信息资源。
- 单位
