舟山近海水样环境DNA获取方法的建立

作者：陈治; 宋娜; 源利文; 邬倩倩; 高天翔^*

来源：水生生物学报, 2020, 44(01): 50-58.

DOI：10.7541/2020.007

• 环境DNA
• 获取方法
• 曼氏无针乌贼
• 舟山近海水域

以曼氏无针乌贼(Sepiella japonica)为研究对象,通过绝对定量技术建立和优化了舟山近海高浊度水样环境DNA(Environmental DNA, eDNA)的获取方法。研究结果如下:(1)同体积水样采用乙醇沉淀法获得的eDNA产量是滤膜抽滤法的1.76—2.53倍,但在实际应用中由于受到采样体积、处理方式、配套设备的限制,乙醇沉淀法难以发挥出优势;(2)滤网对泥沙等杂质无过滤作用,添加滤网并不能过滤掉泥沙及增加抽滤体积;(3)滤膜孔径的大小对少量水样的eDNA产量有很大影响,但对大体积水样eDNA的产量无影响;(4)水样静置处理有可能会增大eDNA产量,但也有可能会增大eDNA结果的波动性,使生物量评估结果误差较大;(5)阳离子表面活性剂对eDNA降解有明显的抑制作用;(6)去膜法效果优于碎膜法,建议使用去膜法进行eDNA消化,使用时增加离心时间;(7)酚抽除沙法虽然不能提高eDNA产量,但能明显提高产物纯度。研究首次建立了舟山近海水样大生物eDNA最适获取方法,为相似水域的水样采集及eDNA提取提供了借鉴参考。

• 单位
  海南热带海洋学院; 浙江海洋大学; 生命学院; 中国海洋大学