绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析

作者：邬张颖; 徐凡舒; 钟依妮; 马佳莹; 朱欣; 张慧娟; 蒋明^*

来源：贵州农业科学, 2020, 48(01): 99-103.

• 绿萝
• 叶腐病病原菌
• 菌株LR12
• 胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种
• 16S rDNA
• 克隆

为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1 700bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1 551bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。

• 单位
  台州学院; 生命科学学院