整合多个基因表达谱数据识别骨肉瘤发生和进展相关的关键基因

作者：韩小玲; 王胜纯; 韩俏英; 梁兰^*

来源：广东医科大学学报, 2023, 41(06): 613-618.

• 骨肉瘤
• GEO数据库
• 关键基因

目的 了解骨肉瘤发生和进展相关的关键基因。方法 将GEO数据库中多个骨肉瘤基因表达谱整合为一个表达矩阵，对骨肉瘤关键基因进行功能注释和通路富集分析，识别模块内与骨肉瘤发生与发展密切相关的关键基因。结果 4个骨肉瘤数据集整合成含有98个样本、13 914个基因表达谱的矩阵文件，识别出骨肉瘤相关程度最高的turquoise模块（cor=0.71, P=4e-16），包括LDHB、CBX2、CCT3、KPNA2、PPAT、MSH6、UBE2C、SNRPA1、CCDC58、TMEM97和KIF2C等11个骨肉瘤关键基因，其中SNRPA1、CCDC58、TMEM97、KIF2C和UBE2C未见报道。结论 发现11个关键基因与骨肉瘤发生和进展相关。

• 单位
  广东医科大学