芸薹属同源异源六倍体(BcBcCcCcCoCo)染色体片段缺失的鉴定及其在色泽形成基因定位中的应用

作者：邱杰; 王泰; 蔡博伟^*; 段圣省; 徐林珊; 陈晓迪; 王晶; 葛贤宏^*; 李再云

来源：作物学报, 2023, 49(11): 2902-2912.

• 芸薹属
• 六倍体
• 染色体缺失
• 花青素
• 类胡萝卜素

多倍化导致物种的基因组趋于复杂,基因拷贝数增多,为性状的遗传解析及基因定位、功能分析带来挑战。染色体片段缺失往往导致相应的表型变化,而控制这些表型的基因就位于缺失片段内。根据这个原理可以利用染色体缺失品系迅速、准确地将相关基因定位于特定染色体上/染色体区段内。本研究以紫株、黄花埃塞俄比亚芥(Brassica carinata,BcBcCcCc,2n=34)为母本与绿株、白花芥蓝(Brassica oleracea,CoCo,2n=18)杂交合成同源异源六倍体(BcBcCcCcCoCo)。在杂种幼胚培养、加倍过程中,同一个幼胚愈伤组织中分化出2种表型不同的六倍体植株:紫株、淡黄花与绿株、白花。细胞学观察、荧光原位杂交、基因组重测序分析表明与紫株相比,绿株基因组B04染色体存在大片段缺失。转录组分析表明,缺失区段内的DFR基因以及位于参考基因组B03染色体上的MYB90基因可能为控制紫株六倍体紫色形成的关键基因;而位于缺失区段内的Z-ISO以及CRTISO2则是控制黄色花瓣形成的关键基因。

• 单位
  华中农业大学