人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3'UTR进化保守性关系的分析

作者：刘哲言; 卢一鸣; 屈武斌; 张成岗

来源：军事医学, 2013, (11): 808-813.

• 管家基因
• 非管家基因
• microRNA
• 基于序列的预测
• 表达谱数据
• 进化分析 housekeeping genes
• non-housekeeping genes
• sequence-based prediction
• expression profiles data
• evolution analysis

目的该研究从整体水平比较microRNA(miRNA)对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3'UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析,以获得miRNA对两类基因的调控情况,同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3'UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3'UTR上有显著地高密度绑定,管家基因的3'UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用,对于重新理解miRNA对真核生物基因...

• 单位
  军事医学科学院; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所; 蛋白质组学国家重点实验室; 安徽医科大学