小黑杨MYB32基因生物信息学及应答盐胁迫分析

作者：顾咏梅; 夏鑫慧; 王宇婷; 贾丰璘; 姜廷波; 周博如^*

来源：山西农业大学学报(自然科学版), 2021, 41(06): 32-40.

DOI：10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202108046

• MYB家族
• 转录因子
• 小黑杨
• 盐胁迫

[目的]MYB转录因子家族在调节植物代谢、信号转导、抗逆和细胞分化等生物过程中具有重要作用。本文以小黑杨(Populus simonii×P. nigra)为试验材料,探究MYB32在逆境境胁迫下的分子机制,对培育具有抗性的转基因林木具有现实意义。[方法]通过软件或在线预测对MYB32基因进行生物信息学分析;将培养1个月的小黑杨组培苗继续水培15 d后,分别用水和150 mmol·L-1的NaCl处理6组时间点(3个生物学重复),利用2-ΔΔCt算法计算相对表达量并绘制时空表达模型;采用烟草注射的方法对该基因进行亚细胞定位分析;构建MYB32-pGBKT7重组质粒转入酵母细胞,经筛选培养基培育以确认该基因是否具有自激活活性。[结果]MYB32基因全长864 bp,编码287个氨基酸,该蛋白不具备跨膜结构域,不包含信号肽,GRAVY小于0、属于不稳定的亲水蛋白;启动子预测显示该基因包含Pbox、G-Box、E-box等种胁迫应答元件;时空表达模型反映该基因在盐胁迫条件下,根中的表达量明显高于其他组织;MYB32编码的蛋白在细胞核中表达;该基因编码的蛋白具有自激活活性,激活区域在第205～242位氨基酸之间。[结论]经时空表达模型结果推测该基因与植物渗透调节相关,可能参与植物抗逆胁迫;MYB32的启动子序列中包含了多种顺式作用元件,这些元件在植物应答各种胁迫过程中可能发挥了重要作用。

• 单位
  东北林业大学