橡胶死皮相关液泡型水通道蛋白基因TIP1的克隆与序列分析

作者：邹智; **华; 莫业勇; 安峰; 杨礼富

来源：安徽农业科学, 2013, 41(36): 13851-13854.

DOI：10.3969/j.issn.0517-6611.2013.36.011

• 橡胶树
• 死皮
• 水通道蛋白

[目的]死皮是指橡胶树(Hevea brasiliensis)产排胶过程中出现的一种割线症状,它会造成橡胶减产甚至完全绝收。研究对一死皮相关的水通道蛋白(Aquaporin,AQP)基因进行克隆和序列分析,以探讨AQP在死皮发生过程中的作用。[方法]基于一条在死皮植株中下调表达的EST,研究采用电子克隆和RT-PCR相结合的方法从橡胶树的树皮中扩增出HbTIP1 774 bp的cDNA,在此基础上采用生物信息学对基因的序列特征、编码蛋白的理化特性及进化关系进行了分析。[结果]该cDNA包含759 bp的ORF、8 bp的5’UTR和7 bp的3’UTR;基因预测编码252个氨基酸,理论分子量为25.88 kD,等电点为4.96。生物信息学分析显示,HbTIP1含有1个保守的MIP结构域,6个跨膜螺旋,液泡膜定位,可归为水通道蛋白(Aquaporin,AQP)家族TIP亚族。同源分析显示,HbTIP1与可可(Theobroma cacao)、人参(Prunus persica)、橙子(Citrus sinensis)和蓖麻(Ricinus communis)中同源蛋白的相似性都在90%以上,显示出高度的保守性。[结论]该研究为下一步揭示AQP调控死皮发生机制创造了条件。

• 单位
  中国热带农业科学院橡胶研究所; 农业部