猴樟CbMYB308转录因子基因克隆及生物信息学分析

作者:胡甜; 叶苏梅; 郝瑷滢; 王艺润; 韩浩章*; 张颖; 王晓李; 张丽华
来源:安徽农学通报(上半月刊), 2023, 29(03): 14-17.
DOI:10.16377/j.cnki.issn1007-7731.2023.03.008

摘要

为研究猴樟CbMYB308蛋白的序列结构和功能,该文克隆猴樟CbMYB308基因CDS序列,进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列具有1个942 bp完整的ORF框,编码313个氨基酸,与沉水樟中收录的RWR91885.1基因序列一致性达97.29%,系统进化树的结果表明,猴樟CbMYB308蛋白具有较高的保守性;猴樟CbMYB308蛋白生物信息学分析结果表明,CbMYB308蛋白具有PLN03091家族结构域,为R2R3-MYB型转录因子,CbMYB308蛋白化学分子式为C1496H2356N432O489S11,相对分子量34.57 kDa,理论等电点6.12,结构不稳定,无序化特征明显,为脂溶性和亲水性蛋白,磷酸化氨基酸位点有53个,亚细胞定位预测为细胞核。

  • 单位
    宿迁学院

全文