斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析

作者：赵学亮; 王姝懿; 呼和巴特尔; 冯陈晨; 孙柯; 王文龙

来源：中国农业大学学报, 2019, (06): 116-123.

• 原核表达载体
• SHR基因
• 抗原表位
• 生物信息学 prokaryotic expression vector
• SHR gene
• antigenic epitopes
• bioinformation analysis

为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗...

• 单位
  内蒙古自治区综合疾病预防控制中心; 内蒙古农业大学