基于mRNA高通量测序筛选调控小鼠术后谵妄重要差异基因

作者：饶耘菊; 陈思雨; 杨海红; 巩固

来源：四川医学, 2022, 43(12): 1191-1196.

DOI：10.16252/j.cnki.issn1004-0501-2022.12.005

• 术后谵妄
• 高通量测序
• 关键差异基因

目的 基于高通量测序技术筛选小鼠海马组织中术后谵妄(POD)发生的相关重要差异基因。方法 将16只健康雌性C57小鼠随机分为术后谵妄(POD组)和对照组(CON组),每组8只。采用异氟烷麻醉下剖腹探查构建POD模型，术后多时间点行为学检测POD改变。于造模后24 h收集小鼠海马组织进行高通量测序，对显著差异基因进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路数据库分析，采用RT-qPCR验证关键差异表达基因(DEGs)。结果 相比于对照组，POD组共鉴定了105个DEGs,其中79个DEGs上调，26个DEGs下调；GO分析结果显示，主要富集的生物过程包括应激反应、代谢过程等，主要表达于细胞器、细胞膜，参与的分子过程涉及转录活性调节等。KEGG分析提示，通路主要富集于NF-κB、趋化因子、mTOR、FoxO和Hippo等信号通路；综合上述结果并结合RT-qPCR验证筛选出Cdkn1a、Nfkbia、Card14、Wnt3、Bcl2、Gng11、Grm3和Akt2 8个关键基因。结论 高通量测序筛选出的差异表达基因，可能通过NF-κB、趋化因子、mTOR等信号通路介导POD发生。

• 单位
  西南医科大学