积极推进二级学院治理对实现大学善治、建设现代大学制度具有重要意义。受科层式管理、传统治理的影响,当前二级学院治理面临结构不合理、权力失衡和文化缺失的困境。分布式领导作为一种新型领导理念,为完善二级学院治理提供了新思路。为完善二级学院治理,学院应建立起多元共治、分工协作的扁平化组织,在外处理好与学校和政府的层级关系,在内要平衡政治、行政和学术三大权力关系,同时通过制度安排和价值引导推进治理文化建设。