应用计算机软件辅助重组hbFGF基因的筛选

作者：黄更生; 孙奋勇; 卜丹

来源：现代生物医学进展, 2006, (08): 19-21.

DOI：10.3969/j.issn.1673-6273.2006.08.007

• 计算机
• DNAsis2.5
• hbFGF
• 自由能

目的:尝试通过计算机的辅助筛选基因重组组合,期望能减少人工筛选的工作量并得到高表达的蛋白。方法:从影响表达的两个因素即翻译起始区TIR的二级结构自由能和翻译起始区的密码子偏好性问题研究入手,对部分核苷酸进行了突变,利用RNA二级结构预测软件DNASISv2.5对hbFGF的TIR区起始密码子开始前35个核苷酸进行了分析,筛选出预期表达量高的组合并在实验中加以验证。结果:从32种突变方式中筛选出10条自由能绝对值最低的序列做引物,克隆至表达载体上,得到了两株高表达菌株。结论:利用计算机辅助设计可以优化和筛选实验结果,提高工作效率,降低具体实验的工作量。

• 单位
  广东教育学院; 暨南大学