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摘要
目的探讨环状RNA(circRNA)在胃癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化,分析两者之间的差异,筛选差异表达的circRNA,鉴定并进行功能预测。方法通过高通量circRNA芯片技术筛选胃癌病人癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,经过对原始数据进行预处理、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并使用实时定量PCR(RT-qPCR)技术对其进行验证和生物信息学预测。结果芯片检测结果显示,胃癌组织样本与其对应的癌旁组织样本之间存在1 042条差异表达的circRNA,其中在肿瘤组织中高表达的有475条,低表达的有567条(变化≥2倍且P<0.05)。对筛选所得的差异表达circRNA的亲本基因进行生物信息学分析,预测了其潜在的生物学功能。RT-qPCR结果显示在上调最显著的6个circRNA中,只有hsacirc0001666在胃癌细胞系和组织中的表达与芯片结果一致。Arraystar自主研发的miRNA靶标预测软件显示,hsacirc000166可能通过结合hsa-miR-450a-1-3p、hsa-miR-661、hsa-miR-493-5p、hsa-miR-208a-5p和hsa-miR-612发挥其miRNA"海绵"的功能。结论胃癌组织与对应癌旁组织比较,circRNA表达谱发生了显著变化,这些差异表达的circRNA可能与胃癌的发生发展密切相关。
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