狗枣猕猴桃AkHSP20基因的生物信息学分析

作者：刘丹; 毕德泷; 陈鑫; 王立凤

来源：贵州农业科学, 2019, 47(12): 87-90.

• 狗枣猕猴桃
• AkHSP20
• 生物信息学

为探明狗枣猕猴桃AkHSP20的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkHSP20的cDNA全长为922bp,CDS为582bp,编码蛋白是由194个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于HSP20蛋白家族(ID 10157978),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,与其他15种植物的HSP氨基酸序列进行对比,表明其与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。

• 单位
  牡丹江师范学院