CENPF基因在肝细胞癌中的表达情况及其基因集富集分析

作者：李涛; 王盼梁; 袁梓博; 火钟坤; 史冀华; 李捷^*

来源：河南医学研究, 2021, 30(17): 3077-3080.

• 肝细胞癌
• 着丝粒蛋白F
• 基因集富集分析

目的探讨着丝粒蛋白F(CENPF)基因在肝细胞癌中的表达情况及其与患者临床特征、预后的关系,通过基因集富集分析(GSEA)寻找CENPF基因在肝细胞癌中的相关调控通路。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取369例肝细胞癌组织样本和50例癌旁组织样本CENPF基因表达数据,以及其中240例病例的临床资料和术后随访资料。CENPF基因表达水平与肝细胞癌患者临床特征的相关性采用χ2检验,CENPF基因表达水平对患者预后的影响采用Cox回归分析,通过GSEA寻找高表达CENPF基因的肝细胞癌样本所富集的基因集。结果肝细胞癌组织中CENPF基因表达水平高于癌旁组织(P<0.05)。肝细胞癌组织中CENPF基因表达水平与病理学分级、血清甲胎蛋白(AFP)水平有关(P<0.05)。多因素Cox回归分析结果显示,TNM分期、血管侵犯和CENPF基因表达水平是肝细胞癌患者死亡的独立危险因素(P<0.05)。GSEA显示,CENPF基因高表达的肝细胞癌样本富集了与DNA复制、剪接体、细胞周期、同源重组、泛素介导的蛋白水解、错配修复等相关的基因集。结论肝细胞癌组织中CENPF基因呈高表达,其表达水平与病理学分级、血清甲胎蛋白(AFP)水平有关,是患者预后不良的危险因素。CENPF基因可能是肝细胞癌患者诊断和治疗的潜在靶点。

• 单位
  郑州大学第一附属医院