permutation-PCA方法在病例对照关联分析中不同遗传模型下的表现

作者：彭倩倩; 薛付忠

来源：山东大学学报(医学版), 2009, 47(03): 94-97.

• 关联分析
• 病例对照
• 遗传模型
• 主成分分析
• 置换检验

目的提出一种基于置换检验(permutation test)和主成分分析(PCA)的检验方法-permutation-PCA。探讨在病例对照关联分析中permutation-PCA在不同遗传模型下的表现。方法基于"首吸飘感"对照组数据分别模拟产生7种不同遗传模型下的病例对照基因分型数据,采用permutation-PCA方法对模拟数据进行检验,并进一步用permuta-tion-PCA方法检验"首吸飘感"基因分型实际数据。结果Permutation-PCA方法对7种不同遗传模型假设下的模拟病例对照基因分型数据的检验结果差异均具有统计学意义(P均<0.05)。Permutation-PCA方法对于"首吸飘感"基因分型实际数据的检验结果差异具有统计学意义(P<0.05)。结论Permutation-PCA方法对不同遗传模型假设不敏感,适用于复杂疾病关联分析中病例对照基因分型数据的研究。

• 单位
  公共卫生学院; 山东大学