骨肉瘤中铜死亡相关亚型的鉴定、预后模型的构建以及免疫细胞浸润分析

作者：邵子晨; 李华南^*; 章晓云; 孙伟康; 袁启鹏

来源：中国免疫学杂志, 2023, 1-14.

• 铜诱导细胞死亡
• 骨肉瘤
• 一致聚类
• 免疫浸润
• 预后模型

目的：在铜死亡基因的基础上，分析骨肉瘤（Osteosarcoma，OS）中铜死亡基因相关亚型的鉴定、预后模型的构建和免疫浸润的影响。方法：在本研究中，我们联合TARGET与GEO数据库，对骨肉瘤相关铜死亡基因进行生存分析及预后的相关性分析。采用一致性聚类方法将骨肉瘤划分为铜死亡不同亚型。同时运用SSGSEA对铜死亡分型进行免疫细胞差异分析。设置pvalue=0.05和qvalue=0.05，对铜死亡分型的差异基因进行GO及KEGG富集分析。依据Lasso回归分析及交叉验证的结果来构建预后模型，并进行风险评估分析和运用ROC曲线来评估模型预测的准确性。结合临床性状，构建列线图来预测病人的生存期，同时进行风险差异分析。对OS样本进行免疫细胞浸润和肿瘤微环境分析。最后运用R中“pRRophetic”包对OS样本进行药物敏感性分析。结果：我们确定了FDX1、GLS、DLAT和PDHB为OS预后的高风险基因。对OS样本进行铜死亡分型，可将OS分成两型：CRGclusterA与CRGclusterB。其中CRGclusterA与TH2细胞相关，CRGclusterB与TH1细胞相关。大部分OS铜死亡基因在CRGclusterA中呈现高表达。免疫细胞浸润分析结果表明，γδ T细胞、静息肥大细胞和静息树突状细胞与风险评分呈正相关，而CD8 T细胞与风险评分呈负相关。药物敏感性分析显示OS疾病对Elesclomol与GW.441756药物更敏感。结论：本研究识别出CRGclusterA与CRGclusterB两种亚型。鉴定出4个预后的高风险基因（FDX1、GLS、DLAT和PDHB）。我们的研究结果将为骨肉瘤的预后评估和免疫治疗候选靶点提供了新的见解。

• 单位
  广西中医药大学附属瑞康医院; 江西中医药大学附属医院; 江西省中医院