学科建设绩效评价是引导学科资源合理化配置的有效手段。以江苏高校优势学科建设工程在建优势学科为例,构建相应的投入—产出型绩效评价指标体系,并利用DEA和Malmquist指数法对优势学科建设的质量和效率进行静态和动态相结合的实证分析和科学评价,验证了所构建的学科绩效评价体系有效性。优势学科建设绩效评价的政策建议是:完善学科绩效评价机制,加强制度建设;强化学科评价结果运用,优化配置资源;动态监测评估学科绩效,培育一流学科。