科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
白鸡冠茶树是光照敏感型茶树，为挖掘与白鸡冠茶树在光照和遮荫条件下叶色变化相关的关键基因，选取遮荫和恢复光照处理白鸡冠第二叶5个时期的转录组数据，通过加权网络共表达分析（WGCNA）方法构建模块。6580个差异表达基因构建的WGCNA网络被分为15个模块，其中darkseagreen模块与叶绿素含量相对值（SPAD值）显著正相关，honeydew模块和SPAD值显著负相关。GO富集结果表明darkseagreen模块显著富集到初级代谢过程的调节和压力响应等过程，而honeydew模块在叶绿体和单器官代谢等过程显著富集。从darkseagreen模块和honeydew模块中发掘到数个潜在核心基因，并采用Cytoscape对darkseagreen模块和honeydew模块的基因绘制互作网络图，进而从darkseagreen模块筛选出2个基因（CSS0019351、CSS0045917）和2个转录因子（CSS0046793和CSS0018417），在honeydew模块筛选出2个基因（CSS0031492和CSS0036305）和1个转录因子（CSS0023211）。综上，WGCNA方法筛选出2个具有生物学意义的模块，进一步挖掘得到的7个关键基因和转录因子与叶绿素合成和叶绿体发育密切相关。
-
单位福建农林大学; 武夷星茶业有限公司
