摘要
旨在通过高通量测序技术比较饲料磷真消化率不同的山羊瘤胃微生物结构与组成的差异。本研究选取28只10月龄,雌性,平均体重(24. 25±2. 47) kg的努比亚黑山羊作为试验动物。通过两次消化试验,然后测定山羊饲料和粪便样品中的磷含量,采用差量法计算所有山羊饲料磷的真消化率。从所有山羊中筛选出高(HP)和低(LP)饲料磷真消化率组,每组各6只。分别采集HP、LP组每只山羊瘤胃内容物,提取微生物总DNA,用细菌通用引物,针对细菌16S rRNA基因的高可变区进行PCR扩增,利用Illumina MiSeq平台对扩增子进行高通量测序,并用QIIME等软件对测序序列进行生物信息学分析。结果表明:1) HP组山羊血液中磷的含量显著高于LP组(P <0. 05)。2)在门水平上,厚壁菌门和拟杆菌门在两组山羊瘤胃微生物中均为优势菌门。3)在属水平,有10个菌属的相对丰度在组间具有显著差异;其中,HP组有3个菌属的相对丰度显著高于LP组(P <0. 05),分别为Prevotella、Desulfovibrio和Selenomonas,其它7个菌属(RuminococcaceaeUCG-010、Ruminococcus2、RuminococcaceaeNK4A214group、Saccharofermentans、RuminococcaceaeUCG-014、Butyrivibrio和Clostridium)的相对丰度均显著低于LP组(P <0. 05)。瘤胃微生物的相对丰度与山羊饲料磷的真消化率显著相关。不同饲料磷真消化率山羊的瘤胃微生物结构与组成存在显著性差异。
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