枳GRAS基因家族鉴定及其对低温胁迫的响应

作者：杨杰; 陈蓉; 胡文娟; 吴巧玲; 佟晓楠; 李兴涛^*

来源：植物生理学报, 2022, 58(01): 130-140.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2021.0290

• 枳
• GRAS
• 基因家族
• 进化分析
• 表达模式

本研究基于枳(Poncirus trifoliata)基因组数据,利用生物信息学方法鉴定了枳GRAS基因家族成员,分析了其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系和顺式作用元件,并通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法检测了PtrGRAS家族成员在低温胁迫下的相对表达量。结果表明:在枳基因组中共鉴定出30个GRAS基因,分布在8条染色体上,氨基酸长度范围为441～833 aa,外显子数为1或2,其蛋白序列都具有保守的GRAS结构域;除PtrGRAS3、PtrGRAS11和PtrGRAS30外,其余PtrGRAS基因均分布于细胞核;系统进化分析将30个PtrGRAS基因分成10个亚族;顺式作用元件预测分析得到12个含有低温响应元件的PtrGRAS基因。qRT-PCR数据表明, 12个PtrGRAS基因在低温胁迫下的相对表达量与对照相比存在显著差异,其中, PtrGRAS11、PtrGRAS26和PtrGRAS30受到低温胁迫的强烈诱导,这3个基因的表达量在处理各时期均显著上调。推测PtrGRAS家族成员在抵抗低温胁迫中发挥重要作用。

• 单位
  生命科学学院; 赣南师范大学; 国家脐橙工程技术研究中心