SH2域与磷酸化多肽相互作用的连续溶剂模型研究

作者：袁海斌; 向明礼; 邓小强; 陈俐娟; 石兵; 杨胜勇

来源：西南民族大学学报(自然科学版), 2007, (03): 546-550.

• SH2域
• 磷酸化酪氨酸多肽
• 连续溶剂模型
• 结合能

使用连续溶剂模型方法研究了SH2结构域与磷酸化多肽pYXXX(X为20种常见氨基酸残基中的任意一种)之间的相互作用.首先计算了已知的SH2域-磷酸化酪氨酸多肽复合物之间的结合能,理论计算的结果与实验测得的亲合能之间的相关系数为0.91,验证了理论模型的正确性.然后,用该模型方法计算了SH2域与pYXXX之间的结合能,分析了磷酸化酪氨酸多肽pYXXX中+1,+2,+3位置上残基对结合能的影响.结果表明+2,+3位置上残基的变化对结合能影响较大,+2位置上带负电的残基和+3位置上的疏水性残基有利于SH2域与pYXXX之间的相互作用,这与实验结果一致.

• 单位
  四川大学华西医院; 四川大学; 生物治疗国家重点实验室