帕金森病小脑枢纽基因及诊断模型

作者:包成政; 王功俊; 罗雪莲; 王洁; 蓝学群; 王喻; 陈金梅; 李雪斌*
来源:神经损伤与功能重建, 2023, 18(12): 714-718.
DOI:10.16780/j.cnki.sjssgncj.20220988

摘要

目的:探索帕金森病(PD)小脑的差异表达枢纽基因及构建诊断模型,探讨PD的发病机制,寻求潜在干预靶点。方法:通过GEO数据库获取PD小脑总RNA芯片GSE20314、GSE28894的数据,利用limma和WGCNA筛选出对照组人群和PD患者的差异表达基因;再通过VennDiagram寻找枢纽(Hub)基因。获取Hub基因后再使用逻辑回归分析构建诊断模型,并通过血液样本数据集GSE18838和GSE6613进行验证,计算受试者工作特征曲线(ROC)的曲线下面积(AUC)评估其诊断性能。结果:(1)获得CDKL2、DGKI、ERO1B、SBNO1、SDK2、SYNRG、VPS13C共7个Hub基因。(2)逻辑回归分析获取SBNO1+VPS13C构建诊断模型,ROC曲线显示在GSE20314+GSE2889、GSE18838、GSE6613中的AUC分别为0.9386、0.8663、0.6564。结论:Hub基因SBNO1、VPS13C可能参与PD的发生、发展过程,未来或可作为PD的潜在干预靶点,且基于SBNO1+VPS13C基因构建的诊断模型具有较好的诊断性能。

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