基于生物信息学分析库欣综合征核心基因与互作miRNA

作者：党春晓; 刘鹏飞; 王鼎; 郝迎新; 刘金星; 于潇^*

来源：中南医学科学杂志, 2023, 51(01): 15-18.

DOI：10.15972/j.cnki.43-1509/r.2023.01.004

• 库欣综合征
• 生物信息学
• 核心基因
• miRNA

目的 利用生物信息学筛选库欣综合征(CS)的核心基因及通路，并预测其相互作用的微小核糖核酸(miRNA)及小分子药物。方法 从GEO数据库下载CS基因芯片数据集并筛选出差异表达基因(DEG),随后对差异基因进行功能富集分析、蛋白互作分析、核心基因筛选，预测互作miRNA及小分子药物并进行验证。结果 共筛选出10个核心基因并预测出479个互作miRNA,相关通路集中在PI3K-Akt、cAMP、CS及MAPK信号通路等，奥那司匹、拉帕替尼是较为显著的小分子药物。结论 利用生物信息学方法筛选出参与CS发生发展的前5条信号通路、10个核心基因及479个互作miRNA,并预测出奥那司匹、拉帕替尼等小分子药物。

• 单位
  山东中医药大学附属医院; 山东中医药大学