两株猪细环病毒的全基因组序列分析

作者：袁志乔; 翟洪月; 丁雨善; 马玉静; 李慧敏; 张艺艺; 鲍印; 李娜; 冷超粮^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2022, (09): 85-142.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.07.0260

• 猪细环病毒
• 流行性
• 序列分析
• 遗传变异
• 基因重组

为了研究猪细环病毒(Torque teno sus virus, TTSuV)的流行及遗传变异情况，试验采用PCR方法对从河南省南阳市某规模化养猪场采集的疑似TTSuV阳性猪的淋巴结、肺脏、血清等样品进行检测，并对TTSuV1阳性样品进行全基因组序列测定、同源性分析、遗传进化分析和基因重组分析。结果表明：试验成功从样品中鉴定出2株TTSuV1毒株，其全基因组序列长度分别为2 906,2 920 bp,分别命名为HeN1-A9株和HeN1-A11株。两毒株与GenBank中TTSuV1型参考毒株的同源性为68.8%～96.0%,与GenBank中TTSuVk2型参考毒株同源性为46.8%～47.6%,两毒株之间的同源性为86.4%。基于TTSuV1全基因组序列构建的遗传进化树分析，两毒株均属于TTSuV1c亚型；而基于TTSuV1第3段基因组序列构建的遗传进化树分析，两毒株均属于TTSuV1b亚型。两毒株均是重组毒株，以西班牙的G21株(GU570201)为亲本毒株，我国的LNJZ株(KT968712)提供重组片段，重组位点分别位于基因组2 195～2 530 bp和2 147～2 650 bp处，重组区域为ORF1与ORF3的重叠部分。说明我国已出现新型重组的TTSuV毒株。

• 单位
  南阳师范学院