基于DNA条形码的川贝母及其近缘种的分子鉴定与亲缘关系研究

作者：郑辉; 邓楷煜; 陈安琪; 付绍兵; 周德; 王威威; 倪典墨; 任瑶瑶; 周嘉裕^*; 廖海^*

来源：药学学报, 2019, 54(12): 2326-2334.

DOI：10.16438/j.0513-4870.2019-0514

• 川贝母
• ITS2
• psbA-trnH
• DNA条形码
• PCR-RFLP

基于ITS2与psbA-trnH条形码序列,对川贝母及其近缘种开展分子生物学鉴定与亲缘关系研究。本文在采用《中国药典》规定的PCR-RFLP鉴定方法对川贝母及其近缘种的鉴定基础上,扩增所有样品的ITS2及psbA-trnH条形码序列,对其遗传距离进行分析,构建进化树,评价ITS2及psbA-trnH条形码的鉴定效果,探讨样品的亲缘关系。结果显示, PCR-RFLP方法仅能将样品分为非酶切组(包括平贝母、浙贝母及伊犁贝母)与酶切组(包括浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母与川贝母)。进一步获得川贝母与其近缘种的ITS2与psbA-trnH序列,发现ITS2序列长度为235～239 bp,种内和种间平均遗传距离为0.001和0.022, NJ树能够将样品分为"北方贝母群"(包括平贝母与伊犁贝母)与"南方贝母群"(包括浙贝母、浓蜜贝母、中华贝母、康定贝母、长腺贝母和川贝母)。后者又可细分为浙贝母与"川贝母复合群",其中"川贝母复合群"中的贝母品种具有相近的亲缘关系。psbA-trnH序列长度为337～373 bp,种内及种间的遗传距离为0.263和0.329, NJ树未能有效聚类。说明ITS2条形码序列不仅能够对川贝母及其部分近缘种进行快速、准确地鉴定,还能够清晰不同贝母种之间的亲缘关系,这为川贝母分子标记的开发、药用植物资源的有效保护和合理开发利用提供了重要的理论依据。

• 单位
  西南交通大学; 青海绿康生物开发有限公司