草棉EST-SSRs的遗传评价

作者：余渝; 王志伟; 冯常辉; 张艳欣; 林忠旭; 张献龙

来源：作物学报, 2008, 34(12): 2085-2091.

DOI：10.3721/SP.j.1006.2008.02085

• 草棉
• 表达序列标签
• 简单序列重复
• 多态性信息含量
• 遗传作图 Gossypium herbaceum
• EST
• SSR
• Polymorphism information content (PIC)
• Genetic map

根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR,1～6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST-SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49～0.91之间,平均为0.81。6对引物在BC1种间作图群体[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性。除HAU230b标记在BC1分离群体...

• 单位
  作物遗传改良国家重点实验室; 新疆农垦科学院; 华中农业大学