青海湖裸鲤盐碱耐受过程中的渗透、免疫、代谢相关基因筛选和分析

作者：张海琛; 马清花; 许保可; 阿琳林; 梁健

来源：水产学报, 2022, 1-22.

• 青海湖裸鲤
• 转录组测序
• 盐碱耐受
• 差异表达基因

为探究青海湖裸鲤在盐碱耐受过程中的基因表达变化，对青海湖河口水域以及入湖淡水河-泉吉河中的青海湖裸鲤的鳃、肾脏组织进行转录组测序，筛选青海湖裸鲤耐盐碱过程中发挥作用的免疫、代谢、渗透相关基因。结果显示，使用Trinity对所有样本质控数据(cleandata)进行从头组装后共得到541429个unigene，N50平均长度达612bp。经差异表达分析发现，共有832个基因在2个区域中的青海湖裸鲤鳃、肾脏中共表达。经GO功能注释分析，注释到结合(binding)、细胞过程(cellularprocess)、代谢过程(metabolicprocess)、单一生物过程(single-organismprocess)的DEGs占比较多。KEGG通路分析结果表明，与免疫、代谢、渗透相关的通路得到了富集。根据差异表达基因的GO注释和KEGG信号通路富集分析，我们初步筛选到了青海湖裸鲤渗透相关基因，主要包括钠/钾转运ATP酶(sodium/potassium-transporting，ATPase)、钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶(calcium/calmodulin-dependentproteinkinase)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activatedproteinkinase)、溶质载体家族(solutecarrierfamily)等；免疫相关基因，主要包括白细胞介素(interleukin)、补体(complement)、整合素(integrin)等；代谢相关基因主要有一氧化氮合酶(nitricoxidesynthase)、1， 25-二羟基维生素D(3) 24-羟化酶 (1，25-dihydroxyvitamin D(3) 24-hydroxylase)、细胞色素P450 (cytochrome P450)等。本实验为青海湖裸鲤的组学研究提供了相关数据，同时也为青海湖裸鲤在盐碱耐受方面的适应性研究奠定了基础。

• 单位
  青海大学