基因集富集分析探讨帕金森病和癌症致病基因DJ-1的潜在功能

作者：谢甲钰; **凤; 陈文锋^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(11): 5278-5285.

DOI：10.13417/j.gab.039.005278

• DJ-1
• 帕金森病
• 癌症
• 基因集富集分析

DJ-1又称为PARK7,其突变与癌症或常染色体隐性遗传早发性帕金森病(PD)有关。DJ-1是一种非典型的类过氧化物酶,可作为氧化还原依赖的伴侣蛋白和转录调节因子。本研究通过GEO数据库获取GSE17204数据集的表达矩阵,该数据集通过对人神经母细胞瘤细胞SH-SY5Y进行DJ-1沉默和基因芯片分析获得。采用基因集富集分析方法(GSEA)对该数据集进行分析从而评估DJ-1的可能功能。结果表明:DJ-1沉默的细胞中细胞周期调控信号、mTORC1信号等受到激活、炎症及免疫信号、低氧应激等信号受到明显的抑制。m TORC1信号、低氧应激信号等已经有大量研究显示其与DJ-1功能的联系。因此,本研究基于GSEA的分析结果是可靠的,这为DJ-1功能的研究提供更多的线索。

• 单位
  福州大学