吸烟肺腺癌患者关键基因的生物学分析

作者：陈旭; 程静; 卢薇

来源：浙江医学, 2019, 41(21): 2281-2352.

• 肺癌
• 基因芯片
• 生物信息学

目的从基因水平揭示吸烟参与肺腺癌发病的机制,探索吸烟肺腺癌的关键基因,并进行生物学功能预测。方法从基因芯片公共数据库(GEO)中下载吸烟肺腺癌患者、非吸烟肺腺癌患者及正常对照组的相关基因芯片数据,将数据分为两组,一组为吸烟肺腺癌患者与正常对照;另一组为吸烟肺腺癌患者与非吸烟肺腺癌患者,利用GEO2R进行差异基因分析,筛选出两组中吸烟肺腺癌患者共同差异高表达基因,并采用DAVID数据库对差异高表达基因进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)及Pathway生物信息学分析。结果筛选出两组中吸烟肺腺癌患者共同差异高表达基因112个,其中主要是以极光激酶A(AURKA)基因、叉头框转录因子M1(FOXM1)基因、染色体结构维持蛋白2(SMC2)基因为核心的关键基因组,其生物学作用主要涉及细胞周期、p53信号通路及DNA复制等生物学通路。结论通过对吸烟肺腺癌患者的相关基因芯片数据进行生物信息学分析,提示吸烟对肺腺癌的发病是多基因作用的结果,其中AURKA、FOXM1、SMC2为吸烟肺腺癌患者组织中的核心关键基因,对其相关基因的进一步分析有利于揭示吸烟在肺腺癌患者中的分子生物学作用。

• 单位
  台州学院