独立学院思想政治理论课面临着重视程度不够、教学水平不高、教学内容重复、教学方法单调等问题。改革要更新教学观念,提倡"以学生为本"、完善教学管理机构、提高教师教学水平、整合教学内容、改进教学方法、重视社会实践。