阴虚体质中lncRNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

作者：董丽丹; 李玲孺; 李博怿; 严云; 郑燕飞^*; 王琦^*

来源：世界中医药, 2021, 16(01): 148-159.

• 长链非编码RNA
• 阴虚体质
• 生物信息学
• 中医

目的:体质在疾病的形成、发展和转归中起着重要作用。本研究从转录组学水平首次初步揭示阴虚体质者外周血中lncRNA和mRNA的表达谱及相关作用网络。方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA(4×180 k)表达谱芯片,从阴虚体质(n=10)和平和体质(n=9)者的外周血中分离单个核细胞(PBMCs),采用"limma"方法筛选2组的差异基因,然后对其进行GO功能和IPA通路的显著性富集分析,并寻找lncRNA近距离调控的靶基因。结果:差异表达的lncRNAs和mRNAs均能够将阴虚体质和平和体质进行区分。阴虚体质中有显著差异表达的lncRNAs 829个(282个上调,547个下调)和mRNAs 1 435个(1 038个上调,397个下调)。GO功能富集和IPA作用通路结果提示,这些差异表达基因主要与免疫调节、代谢紊乱和信号传导失常通路显著相关。例如,T细胞受体信号转导,NF-κB信号通路,L-arabinose代谢过程和I型糖尿病信号传导等。确定了7个lncRNA-mRNA相互作用对,比如,LTA-HCP5、ORAI3-AC135048.13和BCL7C-AC135048.13等。结论:阴虚体质易感干眼症、高血压、糖尿病等疾病的物质基础可能与lncRNAs/mRNAs的免疫调节、代谢作用和信号传导失常相关。

• 单位
  北京中医药大学