非小细胞肺癌细胞A549顺铂耐药潜在机制的全转录组测序分析

作者：倪耀军; 徐忠能; 陈胜; 王俊^*

来源：中国胸心血管外科临床杂志, 2021, 28(01): 35-42.

• 非小细胞肺癌
• 顺铂耐药
• 全转录组测序
• ceRNA网络

目的通过全转录组测序分析比较野生型A549细胞和顺铂耐药A549细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制。方法首先建立A549/DDP细胞系,对A549和A549/DDP进行全转录组测序,分别对lnc RNA-seq,circ RNA-seq和mi RNA-seq数据进行差异表达以及功能富集分析(KEGG和GO分析)。然后进行全转录组数据联合分析以及ce RNA网络的构建。结果与A549细胞系相比,其中4 517个lnc RNA、123个circ RNA以及145个mi RNA在A549/DDP细胞中有差异表达。显著富集在与癌症相关的通路上。mi RNA-circ RNA-lnc RNA-m RNA四元网络包含了12个mi RNA,4个circ RNA,23个lnc RNA和9个m RNA节点。经过拓扑学性质分析hsa-mi R-125a-5p和hsa-mi R-125b-5p是顺铂耐药相关的关键mi RNA。结论肿瘤坏死因子信号通路和p53信号通路参与了A549/DPP耐药机制。Hsa-mi R-125a-5p和hsa-mi R-125b-5p可能是逆转顺铂抗性的潜在靶点。

• 单位
  南京医科大学第一附属医院; 南京医科大学