香蕉ADA1家族成员鉴定及其在生物和非生物胁迫下的表达分析

作者:赵琪琪; 任纹慧; 朱慧菲; 吴秋桢; 张春渝; 许小琼; 罗彬彬; 黄玉吉; 陈裕坤; 林玉玲; 赖钟雄*
来源:生物工程学报, 2023, 1-25.
DOI:10.13345/j.cjb.230191

摘要

Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶(Spt-Ada-Gcn5-Acetyltransferase, SAGA)是高度保守的辅助转录起始复合物,转录接头蛋白-激活的改变/缺失亚基1 (alteration/deficiency in activation 1, ADA1),也称作组蛋白H2A功能互作因子1 (histone H2A functional interactor 1, HFI1),它是SAGA核心模块中的一个亚基,在植物生长发育过程中和抗逆性方面发挥着重要的作用。为了解香蕉ADA1的分子特性,本研究基于香蕉基因组数据库,对香蕉ADA1基因家族成员进行鉴定,分析其基本理化性质、系统进化、选择压力、启动子顺式作用元件及生物与非生物胁迫下的表达等。结果显示:香蕉A、B及阿宽蕉基因组中分别有10、6和7个ADA1家族成员;成员均为不稳定的亲水性蛋白,均保守地含有SAGA-Tad1结构域,MaADA1和MbADA1均可与SAGA核心模块中的SAGA相关因子11 (SAGA-associated factor 11, Sgf11)互作;系统发育显示香蕉ADA1基因家族成员可划分为3个亚族,进化过程中大多受纯化选择;香蕉ADA1基因家族成员的基因结构差异性较大;香蕉ADA1基因家族成员含有多个响应激素的作用元件;MaADA1-1可能对香蕉在低温胁迫下的抗性起着更为重要的作用,MaADA1均响应香蕉枯萎病菌胁迫。本研究表明,ADA1基因家族成员在香蕉中高度保守,并可能响应生物与非生物胁迫。

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