基于公共数据库分析TCF3在胃癌中的表达及临床意义

作者：杨实广; 赵奎; 杨晓东; 黄懿恺; 邢春根^*

来源：生物技术, 2023, 33(01): 95-128.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0015

• 胃癌
• TCF3
• 临床预后
• 生物标志物

[目的]探讨TCF3在胃癌组织中的表达水平及其与临床预后的相关性。[方法]通过GEPIA、ULCAN数据库分析TCF3在胃癌组织中的差异性表达、临床病理资料以及与错配修复基因之间的关系，并利用Kaplan-Meier Plotter数据库绘制TCF3与胃癌患者生存预后曲线。根据Spearman相关系数寻找胃癌中和TCF3作用相关的基因，另外对TCF3及其相关基因进行G0/KEGG富集分析，找出其中最具差异性的生物学注释，最后使用String数据库搭建TCF3蛋白质和上下游蛋白的调控互作网络。[结果]胃癌组织中TCF3表达水平明显高于正常胃组织(P<0.05),而且TCF3与错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6、PMS2之间存在显著相关性(P<0.001),另外TCF3表达与肿瘤组织分化程度高低、是否感染幽门螺旋杆菌有关(P<0.05)。生存分析数据表明TCF3表达量越高，胃癌患者的总生存率和进展后生存率越低(P<0.001)。生信富集分析结果显示TCF3及其相关基因在生物遗传信息保存、细胞周期、肿瘤发生发展方面有重要作用(P<0.05),蛋白质网络提示TCF3与ID1、ID2、TWIST1、MYOD1、EP300、GATA1、LYL1、TAL1、LDB1、LMO2等蛋白存在交互作用(P<0.001)。[结论]TCF3基因可作为胃癌临床预后体系中的重要生物标志物。

• 单位
  苏州大学附属第二医院