紫黑链霉菌进化枝菌株Streptomyces solisilvae HNM0141~(T)的全基因组分析

作者：周奕帆; 李陈贵; 许云; 吴文嫱; 夏薇; 黄小龙; 黄东益; 周双清

来源：热带作物学报, 2021, 1-10.

• 紫黑链霉菌
• 16S rRNA基因进化枝放线菌
• 基因组测序
• 次级代谢合成基因簇

Streptomyces solisilvae HNM0141T是紫黑链霉菌16SrRNA基因进化枝放线菌的模式菌株。采用第三代全基因组测序技术，首次获得了菌株S. solisilvae HNM0141T的基因组完成图，其线状基因组长度11，639，536bp，GC含量71.03%，包含9363个蛋白编码基因，18个rRNA基因和67个tRNA 基因。利用antiSMASH 软件，预测到48个次级代谢产物合成基因簇，其中聚酮类（PKS）和非核糖体肽（NRPS）类（包括杂合类型）的基因簇含量丰富。全基因组分析表明菌株S. solisilvae HNM0141T具有强大次级代谢产物合成的能力，预示该菌株在新颖抗生素的挖掘上具有良好的研究潜力。

• 单位
  桂林医学院; 海南大学