基于叶绿体DNA条形码的披麻草药材及其混伪品的分子鉴定

作者：时瑞梓; 田星; 赵禹; 李荣姣; 李国栋

来源：中国现代中药, 2023, 25(01): 31-37.

DOI：10.13313/j.issn.1673-4890.20220513005

• 披麻草
• 叶绿体DNA
• trnV-atpE序列
• psaC-ndhE序列
• 遗传距离
• 系统发育树
• 分子鉴定

目的：分析trnV-atpE、psaC-ndhE序列变异特点，并通过该序列鉴别披麻草不同基原植物与其混伪品。方法：分别提取披麻草3种基原植物及其混伪品的总DNA，以trnV-atpE、psaC-ndhE为DNA条形码候选序列进行聚合酶链式反应（PCR）扩增和测序。采用DnaSP、MEGA软件统计其片段长度、鸟嘌呤（G）+胞嘧啶（C）占比、变异位点个数、简约信息位点、插入或缺失位点，并计算样品K2-P (Kimura 2-parameter)遗传距离和构建邻接法（NJ）系统发育树。结果：trnV-atpE、psaC-ndhE序列长度分别为373～381、491～534 bp，简约信息位点分别为18、15个。trnV-atpE和psaC-ndhE序列中披麻草3种基原植物最大遗传距离均小于与混伪品之间的最小遗传距离。基于2个序列构建的NJ系统发育树显示，披麻草与其混伪品能明显区分。结论：综合分析序列特点和种内、种间变异性，trnV-atpE和psaC-ndhE序列均可将披麻草3种基原植物与其混伪品区分开。

• 单位
  云南中医药大学; 云南医药健康职业学院