基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究

作者：董艳辉; 于宇凤; 温鑫; 王亦学; 聂园军; 侯丽媛; 李亚莉; 刘江; 任元; 王育川; 曹秋芬; 吴慎杰; 王斌^*; 秦永军^*

来源：华北农学报, 2019, 34(02): 205-211.

• 藜麦
• 连作
• 高通量测序
• 根际土壤
• 生物多样性

为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序。结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4%,ACE指数平均值增加22.9%,Shannon指数平均值增加2.3%;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少。功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加。

• 单位
  农业部; 山西省农业科学院生物技术研究中心; 山西省农业科学院农作物品种资源研究所; 山西省农业科学院农业资源与经济研究所; 山西省农业科学院农业环境与资源研究所