高良姜PAL基因的序列和表达模式分析

作者：黄琼林

来源：现代中药研究与实践, 2021, 35(06): 13-16.

DOI：10.13728/j.1673-6427.2021.06.004

• 苯丙氨酸解氨酶
• 高良姜
• cDNA序列
• 表达差异
• 生物信息学

目的分析高良姜黄酮类生物合成第一步反应的关键酶——苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase, PAL)编码基因的序列特征,并明确该基因在高良姜中的表达模式。方法在高良姜转录组测序数据中挖掘PAL基因,采用生物信息学方法分析其编码蛋白的理化特征、组成、结构和细胞亚定位,并采用实时定量PCR分析该基因在高良姜不同组织中表达差异。结果获得的AoPAL cDNA序列长度为2 261 bp,包含2 130 bp编码区,编码710个氨基酸。AoPAL含有苯丙氨酸解氨酶保守功能域,归属苯丙氨酸解氨酶超级家族,且为不含跨膜结构域、信号肽和转运肽的亲水性混合结构型蛋白质。AoPAL表达在高良姜不同组织中呈现特异性,相对表达量为叶<茎<根茎。结论为AoPAL的功能鉴定奠定了研究基础,为阐明高良姜黄酮类物质生物合成途径研究提供理论参考。

• 单位
  广东医科大学; 基础医学院