白血病AML1-ETO融合蛋白转录结合位点在基因组水平的分布规律

作者：何苗苗; 石建涛; 朱雪华; 金雯; 王萍; 张济; 王侃侃

来源：中国实验血液学杂志, 2010, (03): 553-558.

• 急性髓系白血病
• 基因组分布特征
• ChIP-on-chip
• AML1-ETO acute myeloid leukemia
• genomic distribution characteristic
• ChIP-on-chip
• AML1-ETO

本研究探讨白血病t(8;21)染色体易位形成的融合癌蛋白AML1-ETO在2、9、19号3条染色体上基因组水平的结合位点分布,从而探索其在白血病发生发展过程中异常的转录调控模式,为靶向治疗药物研发以及临床治疗方案优化提供理论基础。应用染色质免疫沉淀技术与高通量的基因芯片相结合的ChIP-on-chip技术,使用覆盖上述3条染色体上所有基因组信息的瓦式基因芯片,在具有t(8;21)染色体易位的Kasumi细胞株上展开研究。实验分为抗ETO特异抗体组和随机打断基因组DNA对照组。通过MAT方法分析ETO抗体组相对于对照组的富集片段;应用CEAS分析工具分析富集片段在基因组上的分布特征,并进一步通过...

• 单位
  上海交通大学; 医学基因组学国家重点实验室; 瑞金医院