Asia1型口蹄疫病毒基因组的测序分析

作者：王琳萱; 陈思敏; 张印红; 孙东杰

来源：浙江农业学报, 2014, 26(02): 290-296.

• 口蹄疫病毒
• Asia1/JS/2005
• 基因组

对中国口蹄疫病毒Asia1/JS/2005毒株的全基因组进行了分段扩增并测序。结果表明,该毒株的基因组全长为8 174 nt,其中5’UTR为1 092 nt;ORF为6 990 nt;3’UTR为92 nt。利用DNAstar软件对该毒株和Asia1型其他24毒株基因组序列进行同源性分析表明,该毒株的非结构蛋白和5’UTR比较保守。研究还发现了可能与生物学功能相关的新的保守和变异区域。系统树分析表明Asia1/JS/2005,Asia1/1/YZ/2006,Asia1/WHN/2006,Asia1/HN/2006和Asia1/YS/2005属于同一分支,表明这些毒株间有着紧密的遗传关系,其中与其亲缘关系最为密切的是Asia1/YS/2005。

• 单位
  公共卫生学院; 中国农业科学院兰州兽医研究所; 兰州大学; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室