贵州山核桃转录组文库构建与测序

作者：郭计华; 苗贵东; 姜丽; 桂腾琴; 张培; 邱国俊; 夏可灿

来源：种子, 2021, 40(02): 91-95.

DOI：10.16590/j.cnki.1001-4705.2021.02.091

• 贵州山核桃
• 转录组
• 构建
• 测序

为探讨贵州山核桃(Carya cathayensis Sarg.)转录组功能基因信息,首次使用Illumina Hiseq 2500平台对贵州山核桃进行转录组测序分析,共获得43 241 968个reads片段。经序列组装共计获得98 117条unigene,总长度高达80 841 463 bp, 74.22%的unigene长度集中在1～1 000 bp之间。功能注释结果显示,有58 464个unigene在NR数据库获得注释,注释到葡萄科的占总的unigene 28.7%。另外对获得注释的序列信息进行初步分析,选取生物学特征重要基因(生长相关基因)和油脂合成相关基因进行初步筛查,分别获得15个和16个基因,填补了贵州山核桃转录组功能基因信息空白,为进一步开展贵州山核桃重要品质基因挖掘和功能标记开发奠定了重要的分子基础。

• 单位
  兴义民族师范学院