阿坝藏猪蒲江种群SLA-DRB基因片段SNP检测及其与生长发育性状关联分析

作者：朱未; 朱磊; 何凡; 付磊; 帅素蓉; 江建平^*

来源：四川动物, 2018, 37(05): 497-506.

• 藏猪
• SLA-DRB基因
• 管围
• 免疫功能
• 遗传筛选

猪Sus scrofa domesticus的白细胞抗原复合体(SLA)基因的单核苷酸多态性(SNP)与猪生长发育等性状有关。为了开发藏猪品系选育的遗传标记,本文测定了阿坝藏猪蒲江种群89头个体的SLA-DRB基因部分序列,共鉴定出14个SNP位点。根据位点间的连锁强度分为3个组合(组合1:g. 11470、g. 11945、g. 11997、g. 11387、g. 11369与g. 11829;组合2:g. 11532与g. 11838;组合3:g. 11911与g. 11708)和4个独立多态位点(g. 11468、g. 11440、g. 11478和g. 11944)。将基因型与体质量、体长等14项生长发育性状进行关联性分析,结果表明,组合3的基因型与体高、体长、胸围等11项体尺指标间的相关性均显著(FDR <0. 05),基因型为TT/CG的个体较小,表明SLA-DRB基因可用于藏猪小型化选育的遗传标记。管围和12项管围率(除体质量以外)与SLA-DRB基因多态性的相关性最高,受组合1、组合2和位点g. 11468、g. 11478基因型的极显著影响(FDR <0. 001),其中,基因型为组合1=GGGAAC/GGGAAC、组合2=GT/GT、位点g. 11468=C/C和g. 11478=C/C的个体拥有更大的管围和管围率。管骨骨髓是SLA基因发挥免疫功能的主要场所之一。本研究为基于管围的猪种筛选提供了理论依据和可用的SNP位点,也为藏猪抗病遗传筛选提供了基础数据和参考资料。

• 单位
  中国科学院成都生物研究所; 四川农业大学; 动物科技学院