广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查

作者:黎聪荣; 白茹; 邓洁莉; 车荣飞; 梁丹; 赵卫*; 柯昌文*
来源:中国病原生物学杂志, 2020, 15(06): 685-697.
DOI:10.13350/j.cjpb.200613

摘要

目的了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况。方法于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析。结果成功获得7株H3N2亚型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位点序列均为PEKQTR↓GL,与典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分离株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。HA蛋白受体结合位点、神经氨酸酶耐药位点、M基因上的金刚烷胺类药物耐药位点、PB2基因上与哺乳动物适应性相关位点等均未发生突变。系统进化分析显示,7株分离株的8个基因片段均处在欧亚禽源分支中,但相互间存在差距。结论 7株分离株中存在5种组合的重配H3N2亚型禽流感病毒,其中1株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。因此应加强活禽市场及环境监测,防止产生能在人群中流行的重配H3N2病毒。

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