基于辣椒基因组测序探究辣味在种群中的进化

作者：Seungill Kim; Minkyu Park; Seon-In Yeom; Yong-Min Kim; Je Min Lee; Hyun-Ah Lee; Eunyoung Seo; Jaeyoung Choi; Kyeongchae Cheong; Ki-Tae Kim; Kyongyong Jung; Gir-Won Lee; Sang-Keun Oh; Chungyun Bae; Saet-Byul Kim; Hye-Young Lee; Shin-Young Kim; Myung-Shin Kim; Byoung-Cheorl Kang; Yeong Deuk Jo; Hee-Bum Yang; Hee-Jin Jeong; Won-Hee Kang; Jin-Kyung Kwon; Chanseok Shin; Jae Yun Lim; June Hyun Park; Jin Hoe Huh; June-Sik Kim; Byung-Dong Kim; Oded Cohen; Ilan Paran; Mi Chung Suh; Saet Buyl Lee

来源：辣椒杂志, 2014, 12(02): 40-50.

DOI：10.16847/j.cnki.issn.1672-4542.2014.02.014

• 辣椒
• 番茄果实
• 家族
• 果实成熟
• 茄果类
• 家系
• 番柿
• 番茄
• 辣椒素
• 基因组测序
• 辣味

辣椒(Capsicum annuum)是美洲最古老的驯化作物之一,在全世界被广泛种植。本研究对CM334(墨西哥地方品种)进行了全基因组测序和组装(覆盖度为186.6×),同时还对另外两个栽培种和一个野生种分别进行了重测序和从头(de novo)测序。结果表明辣椒基因组大小约为番茄的4倍,辣椒基因组上存在大量gypsy转座子和花椰菜病毒家族元件的积累。结合转录组综合分析认为,辣椒素合成酶基因表达模式的改变及新功能化是导致辣椒素生物合成的原因,研究还发现辣椒与番茄在乙烯合成及果实成熟调控方面存在明显不同的分子模式。辣椒参考基因组的发布为辣椒营养品质和药用价值的改善提供了重要平台。

• 单位
  湖南省蔬菜研究所