赤水乌骨鸡PTGDS基因克隆、序列特征及组织表达分析

作者：吴芸; 欧正淼; 殴小嫚; 陈粉粉; 闫吉美; 李盼盼

来源：江苏农业科学, 2023, 51(23): 22-27.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2023.23.004

• 赤水乌骨鸡
• PTGDS基因
• 生物信息学分析
• 组织mRNA表达

为研究赤水乌骨鸡PTGDS基因的结构和功能，检测其在赤水乌骨鸡不同组织、胸肌和腿肌中的表达情况，探究PTGDS基因对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR获得PTGDS基因CDS序列，对其氨基酸序列进行生物信息学分析，揭示其结构特征和亲缘关系，同时通过qPCR检测赤水乌骨鸡PTGDS基因在同一时期不同组织中的表达特性。结果显示，赤水乌骨鸡PTGDS基因编码区长558 bp,编码186个氨基酸，保守性分析发现赤水乌骨鸡PTGDS基因与原鸡的同源性最高，核酸和氨基酸序列比对同源性分别为100%;系统进化分析发现，赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近，与黑天鹅和鸿雁的亲缘关系最远。PTGDS基因在各组织中均有表达，在肾中的表达量最高，显著高于其他组织(P<0.05);肌肉中腿肌的表达量高于胸肌，但差异不显著(P>0.05)。研究结果可为进一步揭示PTGDS基因的功能和调控机制提供参考。

• 单位
  西南林业大学; 遵义师范学院; 生命科学学院