松叶猪毛菜干旱胁迫下实时定量PCR内参基因的筛选

作者：闻志彬; 张明理

来源：植物生理学报, 2015, 51(11): 2031-2038.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2015.0498

• 松叶猪毛菜
• 实时荧光定量PCR
• 内参基因
• 干旱胁迫
• 藜科

实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是研究植物基因定量表达的常用手段之一,选择合适的内参基因是获得可信定量结果的前提。本文以不同干旱胁迫处理下松叶猪毛菜的叶片为材料,应用q RT-PCR技术分析5个常用候选管家基因(18S r RNA、α-tubulin、β-actin、EF1-α和GAPDH)的表达变化,利用ge Norm和Norm Finder软件筛选出在干旱胁迫下表达最稳定的内参基因。结果表明,以不同干旱胁迫处理的所有样品作为总样品池进行内参基因筛选时,候选内参基因表达稳定性顺序依次是β-actin>α-tubulin>GAPDH>EF1-α>18S rRNA。对同一干旱处理的样品进行内参基因筛选时,5个候选内参基因表达稳定性存在明显差异,其中β-actin表达稳定度最高。因此,β-actin是研究松叶猪毛菜干旱胁迫下基因表达最合适的内参基因。

• 单位
  中国科学院; 中国科学院新疆生态与地理研究所; 中国科学院植物研究所